Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAD54BQ9Y620 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms