Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF8Q9UPP1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF8Q9UPP1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms