Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC12A4Q9UP95 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms