Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX6Q9UNH7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX6Q9UNH7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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