Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG3Q9UJ98 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms