Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTNNA3Q9UI47 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms