Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ABCF2Q9UG63 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ABCF2Q9UG63 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms