Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APEX2Q9UBZ4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms