Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms