Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TFIP11Q9UBB9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms