Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4Q9P0V3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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