Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CMTM6Q9NX76 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CMTM6Q9NX76 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms