Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPATA16Q9BXB7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms