Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VAMP8Q9BV40 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VAMP8Q9BV40 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms