Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
TMEM208Q9BTX3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms