Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2AFJQ9BTM1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2AFJQ9BTM1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms