Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MCMBPQ9BTE3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms