Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TINF2Q9BSI4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms