Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SPOCK3Q9BQ16 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPOCK3Q9BQ16 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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