Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDRT15Q96T59 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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