Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SENP8Q96LD8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SENP8Q96LD8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms