Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG3Q96JB2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG3Q96JB2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms