Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCARF2Q96GP6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms