Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNFT2Q96EX2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms