Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms