Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM4SF18Q96CE8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TM4SF18Q96CE8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms