Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ROPN1LQ96C74 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ROPN1LQ96C74 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms