Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms