Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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