Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFRP1Q8N474 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms