Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms