Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms