Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP43Q70EL4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP43Q70EL4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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