Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NANOGP8Q6NSW7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NANOGP8Q6NSW7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms