Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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C9orf135Q5VTT2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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