Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CEP170Q5SW79 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms