Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PITRM1Q5JRX3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms