Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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COL24A1Q17RW2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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COL24A1Q17RW2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COL24A1Q17RW2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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COL24A1Q17RW2 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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COL24A1Q17RW2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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COL24A1Q17RW2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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COL24A1Q17RW2 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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COL24A1Q17RW2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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COL24A1Q17RW2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COL24A1Q17RW2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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