Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms