Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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