Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITSN1Q15811 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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