Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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ALX1Q15699 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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ALX1Q15699 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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ALX1Q15699 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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ALX1Q15699 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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ALX1Q15699 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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ALX1Q15699 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALX1Q15699 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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