Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRADDQ15628 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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