Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms