Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms