Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
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EBI3Q14213 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EBI3Q14213 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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