Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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