Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C1orf61Q13536 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1orf61Q13536 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms