Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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