Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LSAMPQ13449 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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